苗医认为不良的自然环境、气候酿制成的毒气是使人患病的重要原因，生活中劳累过度，房事不节，饮食不洁，饮食不调以及情志萎靡，遗传异常，虫、蛇、兽伤害或意外伤害等也是致人患病的主要因素。

苗医根据人罹患的疾病的某些共同特征，普遍地将疾病分为经、证、翻、龟、小儿胎病、新生儿抽病、丹毒、疔、癀、花、疮等类，这些类别的疾病涉及到现代医学的内科、外科、妇科、儿科、神经科、精神科、骨伤科、皮肤科、传染科等科所属的疾病。

苗医诊断疾病的主要方法有望诊、听诊、嗅诊、问诊、摸诊、弹诊、扣诊、刮诊等。通过这些诊法，结合天气、地域及其他条件进行综合分析，判明疾病所属病证，为治疗原则和具体治法提供重要依据。